(1)對有機物來說,帶有醛基、雙鍵、氯取代基及苯環等結構的物質往往對厭氧微生物有抑制作用。如五氯苯酚和纖維素類衍生物,能抑制產乙酸和產甲烷細菌的活動。但經過培養和馴化,厭氧微生物對有毒有機物可以有較強的適應能力,甚至可以將其作為自身活動的營養物質加以消化和利用。

(2)系統中的微量金屬元素是厭氧處理的基本條件之一,同時過量的重金屬又是反應器失效的最普遍和最主要的因素。重金屬通過與微生物酶中的巰基、氨基、羧基等相結合使酶失活,或者通過金屬氫氧化物的凝聚作用使酶沉淀。

(3)氨是厭氧處理過程的營養劑和緩沖劑,但濃度過高時也會對厭氧微生物產生抑制作用。氨氮對厭氧處理系統的影響通過使銨離子濃度升高和pH值上升兩個方面而產生的,主要影響產甲烷階段,一般氨氮產生的抑制作用可逆。氨氮濃度在1500~3000mg/L時,pH值大于7時能產生抑制作用;而濃度超過3000mg/L時,則不論pH值高低如何,氨氮都會對厭氧微生物具有毒性。

(4)硫化物是厭氧微生物的必須營養元素之一,但過量的硫化物會對厭氧處理過程產生強烈的抑制作用。反應器內過高的可溶性硫化物會對細菌的細胞功能產生直接抑制作用,使甲烷菌的種群和數量減少。反應器內的硫酸鹽等含硫化合物在還原為硫化物時,會與產甲烷菌爭奪從有機物脫下來的氫,影響甲烷菌的正常代謝活動。

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